近日，由北京博奧晶典生物技術(shù)技術(shù)有限公司（博奧晶典）與Affymetrix公司聯(lián)合主辦的“分子育種創(chuàng )新論壇——新技術(shù)與新進(jìn)展研討會(huì )”在北京希爾頓酒店隆重舉行。百余名來(lái)自中國科學(xué)院，中國農業(yè)科學(xué)院，中國農業(yè)大學(xué)、南京農業(yè)大學(xué)、鄭州煙草研究院等單位的育種專(zhuān)家學(xué)者出席了此次會(huì )議。
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司總裁許俊泉為大會(huì )致開(kāi)幕辭。許俊泉表示植物分子生物學(xué)技術(shù)一直在不斷地飛速發(fā)展，與此同時(shí)，生物芯片、二代測序等高通量分子檢測技術(shù)的應用給作物育種帶來(lái)了前所未有的機遇和挑戰，以雜交為基礎的傳統育種方式將轉向更精準、高效的分子標記輔助育種方式。尋找和開(kāi)發(fā)與優(yōu)勢性狀緊密連鎖的分子標記，選擇合適的檢測手段或一體化解決方案，將成為實(shí)現分子標記輔助育種的關(guān)鍵。主辦方希望通過(guò)本次論壇，為各位專(zhuān)家及廣大育種工作者提供一個(gè)分子育種最新技術(shù)與進(jìn)展的多方交流平臺，共同推進(jìn)農業(yè)育種的產(chǎn)學(xué)研進(jìn)程。中國農業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所研究員、國家“千人計劃”特聘專(zhuān)家徐云碧教授受邀主持此次論壇。
此次論壇特約8位會(huì )議專(zhuān)題報告嘉賓，他們分別是：中國農業(yè)科學(xué)院賈繼增研究員，中國農業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所徐云碧研究員，中國農業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所黎志康課題組王文生副研究員，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所田志喜研究員，南京農業(yè)大學(xué)作物遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗室喻德躍教授，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司生命科學(xué)服務(wù)部秦文彥主任，Affymetrix產(chǎn)品經(jīng)理王錢(qián)潔博士，北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司農業(yè)項目部任永紅總監。
會(huì )議開(kāi)始，賈繼增研究員做了“小麥高密度SNP芯片的開(kāi)發(fā)和應用”的學(xué)術(shù)報告。報告重點(diǎn)介紹了具有自主知識產(chǎn)權的小麥660K SNP芯片研制思路及進(jìn)展，并與美國、法國和英國此前均推出的不同規格的SNP芯片進(jìn)行了比較。由博奧晶典與賈繼增課題組合作開(kāi)發(fā)的小麥660K高密度SNP芯片，已經(jīng)在全國主要小麥研究單位得到廣泛使用，徹底改變了分子標記完全依賴(lài)國外的局面。該芯片具有通量高，多態(tài)性高，標記密度高，分布均勻，分辨率高，自動(dòng)化程度高，基因組信息清楚，應用范圍廣等諸多優(yōu)點(diǎn)，可以應用于建立高密度遺傳連鎖圖，基因精細作圖與基因克隆，種質(zhì)資源多樣性與基因組育種平臺構建，小麥族分類(lèi)與比較基因組研究等研究和應用方向。
徐云碧研究員做了“分子植物育種：機遇與挑戰”的學(xué)術(shù)報告。報告從我國面臨的糧食安全問(wèn)題挑戰入手，提出產(chǎn)量潛力的提高和產(chǎn)量差的縮小依賴(lài)于各種現代育種方法、綜合農藝措施、社會(huì )經(jīng)濟制度，而分子育種將發(fā)揮重要的作用。接下來(lái)，通過(guò)遺傳變異捕獲與選擇、環(huán)境變異檢測與控制、復雜性狀遺傳改良、育種方法綜合應用等方面的詳細分析，介紹了分子育種的機遇與挑戰。其中，Envirotyping（環(huán)境型鑒定）概念的提出，引起與會(huì )學(xué)者極大的興趣。最后介紹了玉米55KSNP芯片的開(kāi)發(fā)過(guò)程和芯片特點(diǎn)，此芯片適用于種質(zhì)資源指紋圖譜分析，基因初步和精細定位，特別適合于溫熱帶玉米群體，分子標記輔助的回交育種、基因累加、輪回選擇，全基因組選擇，溫熱帶玉米群體的全基因組關(guān)聯(lián)初步分析等。
王文生副研究員做了“3000水稻基因組項目與綠色超級稻育種技術(shù)”的報告。報告指出，我國糧食生產(chǎn)現狀不容樂(lè )觀(guān)，亟待通過(guò)“第二次綠色革命”將“高投入，高產(chǎn)，污染環(huán)境”轉變?yōu)椤吧偻度?、多產(chǎn)出、保護環(huán)境”，并培育出在較低的（肥、水和農藥）投入條件下能夠高產(chǎn)、穩產(chǎn)的“綠色超級稻”。報告還詳細介紹了基于3000水稻基因組項目設計開(kāi)發(fā)水稻全基因組高密度55K芯片的思路和過(guò)程。水稻全基因組高密度55K芯片的多態(tài)性高，具有10-25K的多態(tài)性標記。SNP位點(diǎn)在染色體上間距平均值為6.84K，中位值為5.3K。多樣性SNP標記及可用SNP標記（包括PolyHighResolution, MonoHighResolution, OTV）比例非常高，占芯片總位點(diǎn)的86.6%。
關(guān)于大豆的SNP芯片開(kāi)發(fā)項目，中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所田志喜研究員，南京農業(yè)大學(xué)作物遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗室喻德躍教授，分別以“基因組在大豆育種中應用的一些思考”和“大豆高通量355 K NJAU SoySNP芯片的開(kāi)發(fā)和利用”為主題進(jìn)行了專(zhuān)題報告。
田志喜研究員在其報告中指出，大豆是重要的糧食和油料作物，但目前中國已由大豆原產(chǎn)國和產(chǎn)豆大國轉變?yōu)槭澜缟献畲蟮拇蠖惯M(jìn)口國，大豆危機已經(jīng)影響到我國的糧食安全。因此，需要采用基因組合功能基因組研究方法，對影響大豆產(chǎn)量和品質(zhì)的網(wǎng)絡(luò )調控系統進(jìn)行系統分析，揭示調控大豆種子發(fā)育、植株形態(tài)建成以及品質(zhì)形成的內在機制，促進(jìn)大豆分子育種研究。并在報告中簡(jiǎn)要介紹了大豆SNP芯片的開(kāi)發(fā)思路。
喻德躍教授則重點(diǎn)介紹了NJAU 355 K SoySNP芯片的開(kāi)發(fā)思路和應用領(lǐng)域。NJAU 355 KSoySNP芯片代表性強，SNP位點(diǎn)來(lái)自于野生和栽培大豆SNP數據庫，代表大豆野生和栽培群體的多樣性信息。應用性強，可用于大豆群體多樣性分析及功能基因發(fā)掘。準確性高，355 K SNP標記是在600多萬(wàn)個(gè)SNP根據嚴格標準篩選獲得的。標記分布均勻，標記均勻覆蓋大豆20條染色體，93.6% SNP標記間隔小于9 kb，標記間的平均物理距離為3.3 kb。自動(dòng)化，大豆355 K SNP芯片基于A(yíng)ffymetrix GeneTitan基因芯片分析系統品臺，完全自動(dòng)化讀取數據，不需要人工校正結果，避免人為誤差，準確高效?？梢詰糜诖蠖狗N質(zhì)資源基因型鑒定、品種鑒定、遺傳多樣性分析，大豆農藝性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）研究，功能基因/QTL定位與克隆，大豆分子設計育種（分子標記輔助選擇、全基因組選擇育種等）等。
Affymetrix產(chǎn)品經(jīng)理王錢(qián)潔博士受邀發(fā)表了“Affymetrix 的‘思考’”主題報告，系統解讀了Affymetrix 農業(yè)基因組解決方案，包括Affymetrix的農業(yè)基因組研究策略，Affymetrix Genotyping解決方案，現有的22款用于不同物種研究目錄芯片，用于定制芯片的Axiom篩選+設計的流程，和Axiom Analysis Suite。并詳細介紹了Affymetrix的Eureka Assay平臺和應用，以及最新推出的Axiom 微生物組芯片。
最后，來(lái)自博奧晶典生命科學(xué)服務(wù)部主任秦文彥博士和農業(yè)項目部總監任永紅女士則分別介紹了博奧晶典引進(jìn)的10X Genomics 大片段建庫分析平臺和擁有自主知識產(chǎn)權的微流控芯片在農業(yè)領(lǐng)域的應用介紹。
秦文彥主任介紹，10X平臺的核心優(yōu)勢是使用大于50 kb長(cháng)度的基因組DNA構建測序文庫，克服了二代測序無(wú)法準確獲得大的結構信息的缺點(diǎn)，同時(shí)又避免了三代測序準確性低和價(jià)格昂貴的缺點(diǎn)，將高質(zhì)量測序、獲取大片段結構信息和低成本完美的結合到一起。使用10X平臺構建測序文庫，在育種方面具有的優(yōu)勢包括：基因組de novo組裝：構建遺傳圖譜，提高組裝質(zhì)量，降低成本；大尺度遺傳特征：拷貝數變異和結構變異，提高檢測精度；受單體型調控的性狀研究：增加復雜性狀的分析能力，檢測多個(gè)目標基因在一條染色體上聚集狀態(tài)；微小變異檢測：SNV & Indel檢測，GWAS研究等。經(jīng)濟型、實(shí)用型平臺，實(shí)現準確可靠、快速簡(jiǎn)單、低成本的分子檢測鑒定。
任永紅總監從微流控技術(shù)出發(fā)，整體介紹了博奧晶典的微流控產(chǎn)品以及取得的成果。并詳細介紹了博奧晶典推出的具有中國自主知識產(chǎn)權的微流控SNP芯片檢測系統，這是一個(gè)經(jīng)濟型、實(shí)用型的平臺，能夠實(shí)現準確可靠、快速簡(jiǎn)單、低成本的分子標記檢測，目前在該平臺已經(jīng)進(jìn)行了人、奶牛、玉米和綿羊的SNP分型檢測，取得了很好的結果。博奧晶典希望把微流控SNP芯片檢測系統打造成為一把利器，促進(jìn)農業(yè)育種效率與效益的提升，實(shí)現品種審定、品種權保護、多環(huán)節全方位市場(chǎng)監控。同時(shí)可以從上游的標記開(kāi)發(fā)到下游的生產(chǎn)應用，為廣大工作者提供整體解決方案，成為“公益性基礎研究”向“商業(yè)化育種”轉化應用的橋梁，在多個(gè)層面開(kāi)展廣泛合作，真正推動(dòng)“產(chǎn)學(xué)研用”一體化。
經(jīng)過(guò)一天的學(xué)術(shù)交流，與會(huì )專(zhuān)家對分子育種領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題展開(kāi)了討論并提出了建設性意見(jiàn)。各位參會(huì )嘉賓表示通過(guò)這次會(huì )議進(jìn)一步了解了育種領(lǐng)域的新技術(shù)和新進(jìn)展，同時(shí)與業(yè)內頂級學(xué)者面對面的進(jìn)行了交流，對于自身的科研方向有了很多新的啟發(fā)，收獲頗豐！糧食問(wèn)題關(guān)乎國家安全，種業(yè)發(fā)展是解決糧食問(wèn)題的根本驅動(dòng)力，國家以及各大部委都對種業(yè)發(fā)展都給予了極大的關(guān)注與支持，博奧晶典在后續的發(fā)展中將持續為中國的種業(yè)發(fā)展貢獻出自己的一份力量。感謝所有的參會(huì )嘉賓的溝通聆聽(tīng)，下一屆博奧晶典分子育種創(chuàng )新論壇期待您的參與！
北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司是博奧生物集團有限公司暨生物芯片北京國家工程研究中心的核心子公司。以自主研發(fā)的生物芯片技術(shù)平臺為主，以引進(jìn)轉化吸收各類(lèi)國際領(lǐng)先技術(shù)平臺為輔，立足新一代生物檢測技術(shù)（芯片、測序、多重PCR、質(zhì)譜、細胞分檢等技術(shù)），向國內外生命科學(xué)研究、醫學(xué)檢驗、分子育種、農林畜牧、新藥研發(fā)和食品安全領(lǐng)域提供儀器設備、配套試劑耗材、科研服務(wù)外包、實(shí)驗整體解決方案等，系列產(chǎn)品和服務(wù)已出口北美、歐洲、亞洲等30 個(gè)國家和地區。
博奧晶典始終立足于科研一線(xiàn)，涉及臨床醫學(xué)、農業(yè)育種、食品安全、科學(xué)儀器設備等領(lǐng)域，擁有完善的產(chǎn)、學(xué)、研技術(shù)與人才體系。截至2016年7月，在科研服務(wù)方向共支持客戶(hù)發(fā)表SCI 文章1340多篇，影響因子累計超過(guò)6100分。
測序中國作為本次大會(huì )獨家媒體支持，會(huì )后對博奧晶典總裁許俊泉先生進(jìn)行了獨家專(zhuān)訪(fǎng)，后續的專(zhuān)訪(fǎng)視頻即將出爐，請大家持續關(guān)注我們獲取后續的精彩報道吧！
