2018年9月25日,北京博奧晶典生物技術(shù)有限公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“博奧晶典”)攜手BD(中國)(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“BD”) 成立的博奧晶典—BD(中國)單細胞研究聯(lián)合實(shí)驗室舉行揭牌儀式,并簽署戰略合作協(xié)議。BD全球市場(chǎng)總監Nikhil Rao,BD大中華區基因組業(yè)務(wù)部負責人於莉,BD基因組產(chǎn)品經(jīng)理武鑫,博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監潘良斌博士,博奧晶典科研服務(wù)事業(yè)部總經(jīng)理孟晨等出席揭牌儀式。
簽約儀式上,BD全球市場(chǎng)總監Nikhil Rao與博奧晶典產(chǎn)品研發(fā)中心技術(shù)總監潘良斌博士為實(shí)驗室成立進(jìn)行了揭牌儀式并簽約,該實(shí)驗室的建立旨在單細胞研究領(lǐng)域開(kāi)展合作,共推單細胞測序技術(shù)進(jìn)入臨床轉化新時(shí)代。
博奧晶典-BD(中國)單細胞研究聯(lián)合實(shí)驗室,匯集了BD的Rhapsody單細胞測序分析系統,博奧晶典的單細胞懸液制備體系和生物信息研究院團隊,依托BD(中國)與博奧晶典多年臨床轉化的經(jīng)驗,為單細胞測序技術(shù)進(jìn)入臨床轉化準備好了天時(shí)、地利、人和的沃土。聯(lián)合實(shí)驗室基于單細胞檢測技術(shù),開(kāi)展單細胞靶向基因測序、單細胞蛋白檢測、TCR/BCR檢測, 共同開(kāi)發(fā)國際一流的用于腫瘤、心血管疾病診療應用的單細胞檢測panel,為疾病診斷、預后評估等提供有效參考。
單細胞測序技術(shù)臨床轉化
2009年單細胞測序技術(shù)問(wèn)世,2015年及以后隨著(zhù)Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技術(shù)的出現,徹底降低了單細胞測序的成本門(mén)檻。單細胞測序技術(shù)被廣泛應用于基礎科研和臨床研究,相應成果也備受CNS青睞,如雨后春筍般頻頻出現在高分雜志。單細胞測序技術(shù)的研究成果涉及到腫瘤分型、靶向用藥、免疫治療,動(dòng)植物胚胎發(fā)育,心血管疾病的發(fā)生發(fā)展機制等眾多領(lǐng)域。
2017年,作為單細胞測序技術(shù)臨床應用的拓荒者,耶魯大學(xué)樊榮教授將單細胞測序技術(shù)應用于CART-T治療的監測,他指出,“通過(guò)單細胞水平的檢測,預測腫瘤的發(fā)展趨勢,我們就有機會(huì )從整體水平上為患者制定更好的治療方案?!睘槲覀儗渭毎麥y序技術(shù)應用于臨床帶來(lái)了思路和方向。
Rhapsody采用“分子標簽”技術(shù),基于微孔的原理,其卡式芯片可以在寡核苷酸條形碼標記的磁性微球上,實(shí)現單細胞捕獲和mRNA的反轉錄。然后通過(guò)磁鐵將這些微球吸出合并到單個(gè)管中用于cDNA擴增和文庫構建。構建好的文庫使用Illumina測序平臺對文庫進(jìn)行測序檢測,即可一次性獲得100~10000個(gè)單細胞的基因表達數據,從而實(shí)現在單細胞水平進(jìn)行基因表達測序的目的。
BD Raphsody單細胞分選原理
Rhapsody 三大優(yōu)勢助力臨床轉化
1、每個(gè)panel可以選擇100~1000個(gè)靶向基因,靈活訂制。
靶向方法有助于提高單細胞測序效率,并推動(dòng)對當今一些最具挑戰性的科學(xué)領(lǐng)域的進(jìn)一步探索。經(jīng)驗證的檢測試劑盒(panel)顯示穩定且可重現的細胞異質(zhì)性陣列,可用于探索與眾多應用相關(guān)的細胞類(lèi)型。用戶(hù)可根據需求定制引物,將檢測范圍集中在目標基因,大幅降低后續測序成本。目前已經(jīng)推出了乳腺癌、免疫反應和T細胞三個(gè)靶向基因的檢測Panel。

BD 單細胞靶向基因捕獲原理
2、樣品標記技術(shù)提高樣品通量、同時(shí)降低建庫成本。
Raphsody系統通過(guò)細胞表面通用蛋白的抗體與細胞表面的蛋白進(jìn)行反應, 抗體的尾端加了一段樣品標簽和polyA組成的核酸序列(圖3),此段核酸序列與單個(gè)細胞的mRNA一起進(jìn)行反轉錄和測序。在得到測序數據后通過(guò)分析樣品標簽序列,從而對細胞進(jìn)行樣品來(lái)源的追蹤。
基于該檢測原理,一次實(shí)驗最多可以同時(shí)混合12個(gè)樣品進(jìn)行單細胞測序實(shí)驗,大大降低了單細胞測序的建庫費用,進(jìn)而降低了科研成本。

樣品標記的原理
3、轉錄組與蛋白的聯(lián)合研究,單細胞多組學(xué)研究的開(kāi)創(chuàng )性技術(shù)。
mRNA在翻譯成蛋白的過(guò)程,往往會(huì )發(fā)生轉錄后調控,而出現mRNA的變化趨勢與蛋白不一致甚至相反的趨勢。同時(shí)進(jìn)行mRNA與蛋白的聯(lián)合檢測有利于我們更為完善的檢測細胞內的分子信息,尋找到轉錄后調控的信息、mRNA的可變剪切信息、并通過(guò)2種分子的聯(lián)合檢測進(jìn)一步提高細胞分群的解析度。
其檢測原理主要是通過(guò)多種帶有核酸序列的抗體與細胞同時(shí)發(fā)生反應,帶有相應蛋白的細胞表面通過(guò)抗原抗體特異性結合作用而結合了相應的抗體,接下來(lái)對結合在細胞表面的抗體尾端的核酸序列和mRNA同時(shí)進(jìn)行文庫構建和測序工作。拿到測序數據后,通過(guò)數據分析抗體尾端核酸序列的信息,來(lái)獲取單個(gè)細胞表面蛋白的信息,通過(guò)分析mRNA文庫信息,獲取單個(gè)細胞內基因表達的信息,從而實(shí)現同時(shí)獲取單個(gè)細胞內mRNA和細胞表面蛋白的信息的目的。

單細胞mRNA與蛋白聯(lián)合檢測原理